甲鱼富含蛋白质、钙、磷、铁、维生素A，还含有脂肪、糖、烟酸、维生素B、维生素B1、维生素D、动物胶、角蛋白、碘等物质，营养丰富，无论是红烧还是炖煮，味道都非常鲜美，尤其是背甲周围柔软的分(俗称龟裙)，不肥不油，是其肉质中最美的部分。
鱼肉、鱼甲、鱼头、鱼血都有很好的保健功效，历来被认为是滋补佳品。甲鱼肉味甘性平，有滋阴、清热、散结、凉血、益肾、壮阳、健胃等功效，适用于阴虚、骨蒸、痨热、久疟、久痢、脱肛、子宫下垂、崩漏带下等症。
甲鱼虽然味美，且属大补之物，但是一次却不宜多吃，吃多了会伤食败胃，导致消化不良。
胃口不好，消化功能减退者，产后泄泻的产妇，严重失眠者，更应少食少食。
癌肿患者胃口不好，消化不良，也不宜食用甲鱼。
