肛门闭锁是新生儿的重大畸形疾病之一，肛门闭锁症状出现主要是遗传因素决定的。在怀孕期间发生基因突变及染色体先天性异常是导致肛门闭锁的重要原因，环境因素的刺激也会造成这一畸形症状的出现，包括孕妇在怀孕期间胡乱的服用各种抗生素或者刺激性的药物，以及生活和饮食环境不良等，孕妇在怀孕期间抽烟、喝酒或者经常熬夜，导致自身身体状况不佳等。胚胎在子宫内发育的过程中出现发育异常的情况，也会导致肛门闭锁症状的出现，这种情况往往合并有脊椎及其他部位的异常。
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